单基因遗传病临床基因诊断与产前诊断课件

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【文档说明】单基因遗传病临床基因诊断与产前诊断课件.pptx,共(57)页,1.779 MB,由小橙橙上传

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以下为本文档部分文字说明:

单基因遗传病基因诊断与产前诊断遗传病-任何遗传物质缺陷引起的疾病基因DNA染色体基因病单基因病多基因病遗传病染色体病单基因遗传病➢主要受一对基因控制➢符合孟德尔遗传➢患病率约1/10000单基因遗传病分类遗传模式常染色体显性常染色体隐性性连锁遗传病XLRX

LDY-linked基因与疾病DNARNA蛋白质转录逆转录翻译编码区非编码区非编码区外显子(编码蛋白质)内含子(不编码蛋白质)遗传病检测对象➢原因不明的智障/发育落后、生长迟缓,多发先天畸形,神经肌肉病,遗传代谢病等患

者➢筛查结果阳性者➢家族中有相关遗传病患者夫妇之一染色体异常,或曾生育染色体异常患儿夫妇之一某种单基因病患者/携带者,或生育史孕妇曾生育或家族中有相关遗传病患者的孕育不明原因自然流产、畸胎史、死产或新生儿死亡史孕妇

羊水过多、过少或超声提示异常孕妇夫妇之一致畸因素接触史大于35岁高龄孕妇遗传病家族史并近亲婚配夫妇遗传病筛查阳性者产前诊断-主要针对特定疾病的高风险家庭为什么要做?——患者需求和父母是否有关?➢下次怀孕要怎样做才能避免?➢我们前面生了一个孩子有问题,到底是什么

原因?病因➢我们家里没有遗传病家族史,孩子怎么会得遗传病?来源➢下次怀孕孩子会不会和之前孩子一样,几率多少?风险预防临床意义✓明确诊断基因诊断✓再发预防产前诊断怎么做?—遗传病诊断流程门诊咨询•采集病史、血样•建议检测项目实验检测•样本处理•实验检测临床报告•基因诊断•报告解读如

何开展遗传病基因诊断硬件设施软件设施优先开展致病基因明确、致病机制清楚、检测技术手段成熟、发病率相对较高的遗传病✓遗传咨询医师队伍✓分子遗传学实验技术梯队✓实验报告审核签发人员✓遗传咨询门诊✓实验室技术平台中心技术平台芯片荧光原位杂

交核型分析细胞遗传学检测技术STR连锁分析分子遗传学检测技术突变单基因多基因全外显子全基因组测序、定量PCR、MLPA、targeted-seq、WES、WGS(多重连接依赖扩增技术)脊肌萎缩症(SMA)产前案例➢一

种最常见的致死性常染色体隐性遗传病,发病率1/6000-1/10000➢严重型2-10岁死亡➢目前尚无有效治疗方法➢产前基因诊断是再发预防的临床有效手段脊肌萎缩症(SMA)~95%SMN1纯合缺失~5%SMN1微小突变‘1+0’纯合缺失‘

1d型’‘2+0’‘1+1d’正常人SMA携带者SMA患者SMN1基因型分布SMN1基因缺失SMN1基因(微小突变)SMN1基因SMA家系模式(1)(2)(3)(1)(2)(1)(2)(3)(3)遗传方式_常染色体隐性遗传正常人携带

者患者父亲母亲子代25%缺失正常SMA遗传方式SMA基因诊断与产前诊断⚫PCR-RFLP⚫qPCR⚫MLPA⚫Sanger测序⚫STR(产前)SMA产前诊断-201301qPCR结果SMA产前诊断-201302STR结果13221324122212221111222233222422正常对照孕妇1

3年羊水本胎羊水携带阳性丈夫SMA产前诊断-201801qPCR结果SMA产前诊断-201302STR结果1322131324131222121222121111222233222422SMA临床基因诊断

与个体化产前诊断流程SMA患者临床诊断先证者SMA基因诊断(PCR-RFLP/qPCR)SMN1单拷贝SMN1点突变检测明确致病突变父母突变携带者检测SMN1双拷贝父母携带者检测先证者无样本/已死亡SMN1纯合缺失父母携带者

检测考虑其他神经肌肉病可能qPCR+孕Sa1n6g-e2r4+STRqPCR+PCR-RFLP+STR产前诊断qPCR+STRSMA案例临床经验总结筛查结果解读➢筛查结果2copies,是否是2+0或1+1

d产前诊断风险➢曾经生育史,再婚,配偶SMA携带者筛查阴性,是否做产前?对疾病分子机制的了解,有助于充分告知临床风险先天性肾上腺皮质增生症(CAH)产前案例CAH一组因肾上腺皮质激素合成途径中酶缺陷引起的疾病CAH➢常染色体隐性

遗传➢根据临床表现、生化异常、基因检测分为经典型和非经典型。➢对于临床疑似而生化诊断困难者,或诊断不明已用激素治疗者,基因分析是明确确诊的可靠手段CAH分子致病机理➢MutationsintheCYP21A2geneaccountforapprox

imately95%ofcases➢发病率1/10,000-16,000➢携带率1/605%mutCYP21A2(6p21.3)➢20-25%del;70-7⚫长PCR+Sanger测序⚫MLPA⚫STR(产前)CAH产前诊断结果wt/c.955C>

T;c.1455delG测序结果显示:羊水c.955C>T杂合突变,未见其它突变12121212123431313131wt/c.955C>T;c.1069C>Tc.955C>T;c.1455delG;c.1069C>T111113

33332222241111?携带者正常?产前诊断结果121212wt/12c.955C>T;12c.1455delG3431313131wt/c.955C>T;c.1069C>Tc.955C>T;c.1455delG;c.1069C>T1313131313c.955C>

T;2222241111wt/c.955C>Tc.955C>T/c.1069C>Tc.955C>T;c.1455delGc.1069C>Tc.955C>Tc.1455delGc.1069C>Twt/c.955C>T临床病史产前诊断风

险CAH案例临床经验总结遗传咨询风险25%50%NormalCarrier25%Patient50%Carrier50%Patientorororororororor产前诊断风险wt/c.1455delGc.1455delG/c.1069C>T?c.1069C>T/wt进行性肌营养不良

(Duchenne/Beckermusculardystrophy,DMD/BMD)产前案例DMD患者一般1岁后发病,腓肠肌假性肥大,肌肉无力,病情进展迅速。下肢无力、上楼梯和起立困难,走路呈鸭步型、易摔倒。如果不经康复锻炼,

绝大多数患者在12岁时将丧失行走能力,需要依靠轮椅活动。晚期,患者全身肌肉萎缩,心肌和呼吸肌逐渐受累,大多数患者最后死于呼吸衰竭,死亡年龄在18-20岁左右。尚无有效治疗方法,产前诊断预防出生是有效干预手段DMD全长

2.4Mb,包含79个外显子,是已知的人类最大基因之一X连锁隐性遗传,男性发病率1/3500DMD突变特点外显子缺失:60%外显子扩增:10%其他微小突变:30%DMD基因突变谱⚫测序⚫MLPA⚫qPCR⚫panel(微缺失/重复、错义/无义突变、剪切位点突变)⚫STR(产前)D

MD产前诊断?患儿,男,8y无家族史CK:22300曾外院做过基因,无结果01先症者MLPA结果E18-41dup02孕妇携带者检测结果正常女性孕妇丈夫PCR-SRY羊水为女胎羊水先证携带重复突变03本胎羊水产前诊断结果嵌合?1111122222331113311103DMD本胎羊

水产前诊断结果1111111111YYSTR排除母源污染146产前诊断13(8.9%)携带者42(28.8%)非携带者91(62.3%)男性胎儿55(37.7%)女性胎儿34(23.3%)DMD病人57(39%)正常131例家系146次DMD产前诊断结果28III1122个

家系F20外显子46-50缺失F129外显子18-41扩增8III112231个家系F91外显子18-30缺失生殖嵌合?突变类型母亲母亲携带者非携带者外显子缺失444690外显子重复14216复杂的微小

突变微插入22微缺失628无义突变1111剪切位点突变22错义突变11未知1总8050131数量新发率51.1%12.5%8.3%38.5%(文献报道1/3)DMD产前突变总结DMD:男性活婴发病率1/3500总

的新发率:1/3500*38.5%=1/9091缺失新发率:1/3500*60%*51.1%=1/11,416重复新发率:1/3500*10%*12.5%=1/280,000微突变新发率:1/3500*30%*8.3%=1/140,562缺失新发率/总新发率=79.6%

对DMD外显子缺失进行产前筛查非常重要!DMD新发突变临床疑诊DMD患者分子诊断(MLPA+测序/panel)缺失/重复微小突变未检出突变母亲携带母亲非携带肌肉活检Dystrophin存在Dystroph

in缺失其它神经肌肉病家族史无家族史母亲携带母亲非携带STR+MLPAqPCR+STR+MLPA测序+STR+MLPADMD案例临床经验总结➢生殖嵌合➢新发突变➢临床数据归纳指导优化临床检测流程甲基丙二酸血症

(MMA)产前案例MMA疾病信息常染色体隐性遗传发病率1~2/10000(新华76万,3/10000)临床表现各异,重症患儿可于新生儿期发病。早期死亡率高,预后不良产前基因诊断是临床有效干预措施基因类型编码蛋白OMIM定位MUT甲基丙二酰辅酶A变位酶2

510006p21.1MMAAcb1A2511004q31.1-q31.2MMABcb1B25111012q24MMACHCcb1C2774001p34.1MMADHCcb1D2774102q23.2LMRD1cb1F277

3806q13MMA产前案例孕妇18+2w,28岁先证者外院基因诊断结果:MMACHC(NM_015506.2)c.609G>A(p.W203X);c.656_658delAGA???16年父母本院点验证⚫PCR+Sanger测序⚫qPCR⚫STR(产前)MMA产前诊断羊水未携带父源c.

609G>A羊水携带母源c.656_658delAGA01PCR+Sanger测序结果MMA产前诊断02STR连锁分析结果wt/c.656_658delwt/c.609G>Awt/c.656_658del11121211

121221342323133312131212111313双重方法124131413双线操作1MMA案例临床经验总结临床病史(自然受孕?再婚?其它?)实验室沟通与医师密切沟通医师与病患沟通(明确结果,合理解读报

告)STR:不仅可以排除母源污染,可以连锁分析,还可以保证样本准确无误产前基因诊断病种数40+苯丙氨酸羟化酶缺乏症(PAH)甲基丙二酸血症(MMA)丙酸血症(PCCA/PCCB)脆性X综合征(FMR1)遗传性共济失调(SCA)RETT综合征(MECP2)

6-丙酮酰四氢蝶呤合成酶缺乏(PTS)先天性肾上腺皮质增生症(CAH)进行性肌营养不良(DMD)糖原累积病(GSD)粘多糖病(MPS)脊肌萎缩症(SMA)罕见遗传病/基因亨廷顿舞蹈综合征(HD)VHL综合征常染色体隐性/显性多囊肾单基因病

产前诊断经验总结临床病史医师与实验室沟通先证者样本珍贵,家系样本齐全实验室技术平台完善(多重技术保障)临床遗传咨询,合理评估再发风险产前指征谢谢

小橙橙
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