【文档说明】(完整版)猪链球菌的检测和鉴定技术课件.ppt,共(41)页,4.139 MB,由小橙橙上传
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猪链球菌的检测及鉴定技术链球菌的分类根据各自的种名,如猪链球菌、肺炎链球菌、化脓链球菌等•1986,38种;2002,60种,从链球菌属成员中划分出去新成立了6个属Abiotrophia,Granulicatella,Dolosicoccus,Facklamia,Globicatella
,andIgnavigranum•鉴定不易:常见的、β溶血链球菌相对容易,新发现、不常见、非β溶血链球菌非常困难•VITEKCOMPACT2,35种,包含了新成立的4个属,领先水平链球菌的分类溶血性分类:
1903Shottmuller•α溶血不透明的草绿色溶血环。红细胞不完全溶解,过氧化氢使血红素氧化成为草绿色的正铁血红素。这类细菌致病力不强,多为条件性致病菌。甲型•β溶血完全透明的溶血环,红细胞完全溶解
。这类菌致病力强,常引起人及动物各种疾病。乙型•γ溶血菌落周围无溶血现象。一般为非致病菌。丙型•溶血性分类在鉴定链球菌的致病性方面有一定的意义,但初步分类,意义有限;•区分α溶血和γ溶血意义也很有限,
现可分为β溶血和非β溶血•溶血性受多种因素的影响,特别是猪链球菌猪链球菌的特性•兼性厌氧•血平板上菌落较小(受基础培养基影响)•血平板上溶血性较弱羊血平板均为α溶血马血平板为α溶血或β溶血•革兰氏阳性球菌,成对或成链•过氧化氢酶试
验阴性过氧化氢酶试验是链球菌与葡萄球菌区别的重要反应猪链球菌的血清型•血清学的方法对其进行分型。根据荚膜多糖抗原的差异,用凝集试验等方法可进一步将猪链球菌分为35个血清型,用阿拉伯数字表示,即1~34和1/2型。•SS2型是临床上分离率最高的一种,其次为SS1型。•
SS2型:人畜共患猪链球菌2型分离鉴定操作规程GB/T19915.2-2005–范围•本规程规定了猪链球菌2型分离鉴定的操作方法。•本标准适用于猪及其产品中猪链球菌2型的分离鉴定,也可用于送检菌株的鉴定。猪链球菌2
型检验程序普通琼脂羊血平板无污染病料鉴定为链球菌氧化酶和触酶阴性、G+球菌动物产品菌株选择性普通琼脂羊血平板乳糖+、海藻糖+,七叶苷+、甘露醇-、山梨醇-,马尿酸钠-选择性THB增菌液污染病料荚摸基因PCR检测鉴定为猪链球菌2型溶血素、MRP、EF等毒力因子检测2型血清凝集试验触片镜
检2023/2/17•根据国标,以猪链球菌为例(参照GB/T19915.2-2005)•猪链球菌2型分离鉴定操作规程:a.样品采集b.分离培养c.初步鉴定(菌落形态,革兰氏染色,过氧化氢酶试验)d.生化鉴定(经初步鉴定后,做海藻糖,七叶苷,甘露醇等糖发酵试验或应用法国生物
梅里埃公司API20strep生化鉴定系统进行生化鉴定)e.玻片凝集试验f.实验结果分析判定2023/2/17API系统API微生物鉴定系统以微生物生化理论为基础,借助微生物信息编码技术,为微生物检验提供
了简易、方便、快捷、科学的鉴定程序。API鉴定原理:根据微生物对各种生理条件(温度、pH、氧气、渗透压)、生化指标(唯一碳氮源、抗生素、酶、盐碱性)代谢反应进行分析,并将结果转化成软件可以识别的数据,进行聚类分析,与已知
的参比菌株数据库进行比较,最终对未知菌进行鉴定的一种技术。2023/2/17API试条组成•API20E/RapiD20E革兰氏阴性杆菌鉴定•API20NE非发酵菌鉴定•APISTAPH葡萄球菌及微球菌•APISTREP链球菌鉴
定•API20CAUX酵母菌•API20A厌氧菌•APILISTERIA李斯特菌•APICAMPY弯曲菌属•APICORYNE棒状杆菌•APICH芽胞杆菌/乳酸杆菌2023/2/17全Windows操作界面,多种语言。2023/2/171。API结果两个重要概念:•鉴定百分率(id%):根据
分类单位在数据库中近似程度进行分类,最接近100%。•典型T值:表示实际生化反应与最典型反应的近似程度,最接近反应结果X典型反应ABC根据id%与T值的组合,作出结果的正确评价:•极好的(Excellent)鉴定:id%
>99.9,T>0.75•非常好的(Verygood)鉴定:id%>99.0,T>0.50•好的(Good)鉴定:id%>90.9,T>0.25•可接受的(Acceptable)鉴定:id%>80.0,T>029APISTREP-20生化鉴定猪链球菌的API鉴定
结果APISTREP-20检测结果特性CharacterATCC43765HA9801ATCC3524632210化脓链球菌粪肠球菌乙酰甲基甲醇VP---马尿酸盐HIP---七叶灵ESC++-吡咯酮基芳胺酶PY
RA---α-半乳糖甙酶α-Gal++-β-葡萄糖醛酸酶β-Gur+++β-半乳糖甙酶β-Gal-+-碱性磷酸酶Pal--+亮氨酸芳胺酶Lap+++精氨酸双水解酶ADH+++核糖Rib---L-阿拉伯糖Ara---甘露醇Ma
n---山梨醇Sor--+乳糖Lac+++海藻糖Tre---菊根粉Inu++-棉子糖Raf---淀粉Amd+++糖原Glyg+++β-溶血β-Hem+++编码4641427(92%)4651427(80%
)0461607(99.9%)0161415(99.9%)7143711(98.7%)猪链球菌的API鉴定结果TRE(海藻糖)、RAF(棉子糖)等几个的试验与API菌种库有些不符,但都属于SS2型或1型,数值分类相对于双歧分类的优点ATCC43765HA9801ATCC35246322
10化脓链球菌粪肠球菌编码4641427(92%)4641437(79%)4641423(35%)4651427(80%)4651437(57%)0461607(99.9%)0161415(99.9%)7143711(98.7%)TRE,R
AF,HEMRAF,HEMTRE,RAFTRE,RAF,HEMRAF,HEM猪链球菌的API鉴定结果微生物鉴定全面解决方案15系统名称自动化程度菌悬液配制试条/试卡接种培养条件判读分析手工手工比浊管手工加样自主孵育肉眼判读软件数据库分析自动电子比浊仪DENSIMAT电子连续加样枪自主
孵育数读仪判读软件数据库分析全自动电子比浊仪DensiCHEKPlus仪器整合的充填仓仪器整合的培养箱仪器整合阅读软件数据库高级报告工具微生物鉴定全面解决方案16手工革兰氏染液系统组成19ATBNew是一套半自动的系统,用于鉴定细菌和酵母菌,并检测微生物对抗生素的敏感性。读数仪比
浊仪电子加样枪计算机打印机试条组成试条种类:24h常规鉴定试条Ref.32400,ID32ERef.32100,ID32GNRef.32500,ID32Staph4h快速鉴定试条Ref.32700,rapidID32ERef.32300,rapidID3
2ARef.32600,rapidID32StrepRef.32200,ID32C24工作原理读数仪内部光路利用滤光片来发变换读数斱方式:•4个有色滤光片(橙、紫、蓝、绿)检测比色试条各反应孔在不同波长下的透光率•1个无色的光路利用透光强度T和散射强度S检测比
浊试条各反应孔的透光率(散射测浊)试条26基本操作结果判读仍基于生物编码原理:•试条可借助读数仪迚行判读•大部分试条也可肉眼迚行判读(除ID32GN外)–根据颜色或浊度发化,在产品插页的记彔表格中填入+或者-,通过代码获得11位的数值谱,而后输入ATBNew软件285-+24
04+111--24…00…+…11…系统特色ATBNew系统的优点包含:•采用“金标准”基础上开发的即用型试条,传承了标准化的方法•借助配件实现自动化配制、自动化接种和自动化判读•完整并不断完善的数据库,针对如下几方面进
行定期升级:–微生物分类变化–新菌种的生物学描述–已知菌种生化特点的变化•基于数码参照的可靠结果(id%、T)32系统组成VITEK2Compact是一套全自动的系统,用于鉴定细菌和酵母菌,并检测微生物对抗生素的敏感性。•仪器主机•条码扫描枪•计算机(显示器、
键盘、鼠标)•打印机•稳压电源UPS••••电子比浊仪DensiCHEKPlus盐水分配器配套充填卡架配套加样枪33系统组成仪器主机:•包含用户操作界面的屏幕和按键–可显示仪器的日常状态–可进行卡架的充填和一部分仪器设置、日常维护•最主要的功能集中于两
个仓——充填仓和装载仓–分别有独立的仓门,充填仓门可随时打开(真空充填时除外),装载仓门常处于电子锁闭状态–两个仓门旁均有独立的LED指示灯•此外仪器包含废物收集仓,仓门可随时打开进行清理34系统组成仪器
主机:•仪器还包含两个用户门可打开——顶端用户门和正面用户门–在用户操作界面进行控制–两个门打开后可抵达内部的孵育箱和光学读数组件,可进行维护清理–2个光学读数组件可覆盖3个波长,在孵育的过程中每15min进行一次光学读数•主机右侧有独立的开关,控制主机的通电状态–主机
的运行状态可在用户操作界面进行关闭35试卡组成光学排列标记条形码预先插好的接种管路轨半透膜密封设计风干底物37试卡组成鉴定卡类型及适用菌群:Ref.21342:GP革兰氏阳性细菌鉴定卡⚫⚫⚫⚫可用于鉴定革兰氏阳性球菌(葡萄球菌、链球菌和肠球菌
)及短杄菌(李斯特菌)Ref.21341:GN革兰氏阴性细菌鉴定卡可用于鉴定革兰氏阴性杄菌(肠杄菌科细菌、非发酵菌、弧菌和假单胞菌等)Ref.21347:ANC厌氧菌及棒状杄菌鉴定卡可用于鉴定厌氧菌(梭菌、乳杄菌、双歧杄菌)、部分棒状杄菌及放线菌Ref.21345:BCL芽孢菌鉴定卡可
用于鉴定芽孢杄菌38试卡组成鉴定卡类型及适用菌群:Ref.21348:CBC棒状杄菌鉴定卡⚫⚫⚫可用于鉴定革兰氏阳性无芽孢的杄菌(棒状杄菌、乳杄菌)、短杄菌及部分放线菌Ref.21346:NH奈瑟菌、嗜血杄菌鉴定卡可用于鉴定苛养的革兰氏阴性双球菌(奈瑟球菌)、杄菌(嗜血杄
菌)及弯曲菌Ref.21343:YST酵母菌鉴定卡可用于鉴定酵母样真菌(念珠菌、丝孢酵母)及部分隐球菌398工作原理40TX1TX3光学读数组件分为2个,同步读数可对试卡每个孔的透光率迚行检测:•TX1覆盖1个波长,适合试卡比浊反应孔(鉴定卡的同化反应及药敏卡)•TX3覆盖2个波长,适合鉴定卡的
比色反应孔660nm428-568nm孔对齐基本操作有两种工作模式供选提高灵活性:•装载即走(LoadandGo)模式–用户只需在打印表中记彔样本信息后,直接完成充填和装载–仪器装载孵育时,通过条形码记彔卡片类型、批号
等相关信息,并传输至计算机––用户可在空闲时输入补齐样本信息分流处理更灵活,节约劳劢力•虚拟卡架(VirtualCassette)模式–用户必须设置完虚拟卡架斱可进行充填加载,通过扫描条形码将卡架、卡片信
息传输至计算机,补齐样本信息,建立虚拟卡架––仪器装载孵育后,读取条形码,不事先输入的信息做比较保证了可溯源性,减低误差保证信息的安全41基本操作常用工作流程(VirtualCassette)可概括为:42卡片准备信息连接真空充填装载
孵育报告结果革兰染色基本操作不断升级的系统软件:43系统特色VITEK2Compact系统的优点包含:•采用“金标准”基础上开发的智能型试卡,增强了比色和比浊方法、更多类型底物的融合•••••卡片在装载仓中进行封口,并在完成读
数后自动传送到废物收集仓,使污染的风险最小化一体化机型实现自动化配制、自动化接种、自动化孵育和自动化判读,节约劳动力动态判读法和限定时间的终点判读法加快了周转的时间,可更快得到结果,增强实验室的生产力完整并不断完
善的数据库,增加了单一选择的鉴定结果基于数码参照的可靠结果(id%、T)44系统特色VITEK2Compact针对工业客户开发的特殊功能:•SRF(SupplementalReactFile):适合药厂客户创建自己的数据库,编入
严苛环境下的非典型反应文件,参照创建的数据库进行鉴定•21CFR11模式:可根据FDA的要求启动,借电子记录和签名确保整个操作流程的真实性、完整性和机密性,幵配合审计–安全性进入–电子签名–数据归档•URS(UseRequirementSpecification):预填的文件以帮助户描述仪器规
格•3Q认证包:协助完成仪器的认证规划,指导IQ/OQ/PQ幵完成验证报告45VitekCompact2鉴定结果名称菌株号兰氏分群备注VITEKCOMPACT2备注猪链球菌2型ATCC43765R参考株SS2(97%)BGUR猪链球菌2型AT
CC43765R参考株SSSS1:RAFTRESS2:AspABGURTRE猪链球菌2型HA9801R江苏分离株SS2(97%)BGUR猪链球菌2型HA9801R江苏分离株SSSS1:RAFTRESS2:AspABGURTRE猪链球菌2型21R四川93%猪链球菌2型464
R四川95%猪链球菌的VitekCompact2鉴定结果VitekCompact2鉴定结果马链球菌兽疫亚种ATCC35246C马链球菌兽疫亚种和停乳链球菌似马亚种马链球菌CVCC573CUNID停乳链球
菌CVCC588C似马亚种86%无乳链球菌CVCC1886B95%粪链球菌CVCC1927D95%F群链球菌CVCC1934FUNID无种名兰氏L群链球菌CVCC601L停乳链球菌似马亚种兰氏O群链球菌CVCC604O咽峡炎链球菌
无种名猪链球菌的VitekCompact2鉴定结果VitekCompact2鉴定结果化脓链球菌ATCC12384A98%化脓链球菌ATCC49399A98%化脓链球菌CVCC593A99%?化脓链球菌3221098%大肠埃希氏
菌ATCC25922/99%金黄色葡萄球菌ATCC25923/98%沙门氏菌ATCC9809/99%单增李斯特杆菌ATCC19115/413/99%猪链球菌的VitekCompact2鉴定结果公司简介3TheranosticIndustialMicrobiolo
gy食品安全/营养/健康疫苗/免疫疗法/感染性疾病及癌症临床诊断预防治疗诊断超过30年的友谊并发展公司简介4